
PCR 假陰性(無擴增條帶)快速排查清單(實驗室直接可用)
第一步:先看 3 個對照,定位大方向
陽性對照:無條帶 → 試劑、程序、儀器、配體系問題
陰性對照:無條帶 → 無污染,可排除污染干擾
樣本孔:wei獨樣本無條帶 → 模板本身問題(降解 / 濃度低 / 有抑制物)
第二步:試劑與體系排查(對照無條帶優(yōu)先查)
Taq 酶是否過期、是否室溫放置失活
是否漏加:酶、Buffer、Mg2?、dNTP、引物
Mg2?濃度是否偏低
試劑是否反復凍融、反復開蓋污染
體系配制是否在冰上操作
第三步:引物排查
引物是否過期、降解、稀釋后久放
退火溫度是否過高(最易不出條帶)
引物有無發(fā)夾、二聚體、與模板不匹配
更換新引物重試
第四步:模板核酸排查(樣本無條帶重點查)
核酸是否降解(反復凍融、放置過久)
模板濃度過低、上樣量太少
樣本含抑制物:酚、乙醇、高鹽、血紅蛋白、肝素等
處理方式:模板1:5~1:10 稀釋后重擴
重新提取新鮮核酸
第五步:PCR 擴增程序 & 儀器
退火溫度偏高 → 做溫度梯度下調摸索
起始變性溫度 / 時間不足,雙鏈未解鏈
儀器孔位溫度漂移,換孔 / 換儀器驗證
第六步:電泳及人為操作
瓊脂糖凝膠濃度配制錯誤
電泳時間、電壓不合適
核酸染色不充分、上樣量過少
加樣順序錯誤、交叉污染、配體系算錯體積
第七步:標準解決操作流程
先跑陽性對照,區(qū)分試劑問題還是模板問題
退火溫度做梯度 PCR
樣本模板稀釋后重新擴增
換新酶、新引物、重新提核酸
核對 PCR 程序參數(shù),必要時微調變性、退火時間
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